Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ThpoP40226 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ThpoP40226 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ThpoP40226 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ThpoP40226 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms