Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig1P37913 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lig1P37913 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms