Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc3P33622 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms