Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Saa4P31532 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Saa4P31532 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Saa4P31532 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Saa4P31532 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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