Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc11P31313 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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