Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 AC154843.1-201ENSMUST00000226897 1138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxa2P31245 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms