Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms