Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VtnP29788 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VtnP29788 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VtnP29788 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VtnP29788 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VtnP29788 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VtnP29788 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VtnP29788 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VtnP29788 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VtnP29788 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VtnP29788 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VtnP29788 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VtnP29788 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VtnP29788 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VtnP29788 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VtnP29788 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VtnP29788 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VtnP29788 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VtnP29788 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VtnP29788 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VtnP29788 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms