Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PrkcdP28867 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms