Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NapbP28663 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NapbP28663 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NapbP28663 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NapbP28663 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NapbP28663 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NapbP28663 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NapbP28663 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NapbP28663 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NapbP28663 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NapbP28663 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NapbP28663 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NapbP28663 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NapbP28663 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NapbP28663 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NapbP28663 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NapbP28663 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NapbP28663 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NapbP28663 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NapbP28663 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NapbP28663 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NapbP28663 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NapbP28663 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NapbP28663 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NapbP28663 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NapbP28663 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NapbP28663 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms