Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkcaP20444 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms