Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P20040 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
P20040 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P20040 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P20040 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
P20040 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P20040 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P20040 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P20040 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P20040 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
P20040 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P20040 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P20040 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
P20040 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P20040 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P20040 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P20040 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P20040 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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P20040 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P20040 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
P20040 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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