Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P18529 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P18529 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18529 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18529 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18529 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18529 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18529 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P18529 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P18529 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P18529 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms