Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Spi1P17433 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms