Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcna1P16388 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms