Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FosbP13346 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FosbP13346 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FosbP13346 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FosbP13346 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FosbP13346 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FosbP13346 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FosbP13346 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FosbP13346 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FosbP13346 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FosbP13346 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FosbP13346 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FosbP13346 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FosbP13346 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FosbP13346 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FosbP13346 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FosbP13346 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FosbP13346 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FosbP13346 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms