Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DmdP11531 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
DmdP11531 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DmdP11531 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DmdP11531 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DmdP11531 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DmdP11531 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DmdP11531 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DmdP11531 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DmdP11531 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
DmdP11531 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DmdP11531 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DmdP11531 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DmdP11531 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
DmdP11531 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DmdP11531 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DmdP11531 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DmdP11531 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DmdP11531 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
DmdP11531 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DmdP11531 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DmdP11531 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DmdP11531 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DmdP11531 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DmdP11531 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DmdP11531 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DmdP11531 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DmdP11531 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DmdP11531 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DmdP11531 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DmdP11531 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DmdP11531 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms