Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Tmem254bP0DN90 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms