Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa6P09092 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms