Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ccl20O89093 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ccl20O89093 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ccl20O89093 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ccl20O89093 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ccl20O89093 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ccl20O89093 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ccl20O89093 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ccl20O89093 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ccl20O89093 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ccl20O89093 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccl20O89093 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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