Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lnx1O70263 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms