Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ldb2O55203 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ldb2O55203 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ldb2O55203 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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