Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DffaO54786 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
DffaO54786 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
DffaO54786 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
DffaO54786 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
DffaO54786 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
DffaO54786 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
DffaO54786 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
DffaO54786 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
DffaO54786 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DffaO54786 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DffaO54786 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DffaO54786 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DffaO54786 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DffaO54786 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DffaO54786 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DffaO54786 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DffaO54786 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DffaO54786 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DffaO54786 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DffaO54786 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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