Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CrxO54751 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrxO54751 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms