Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EdaO54693 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EdaO54693 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EdaO54693 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EdaO54693 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EdaO54693 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EdaO54693 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EdaO54693 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EdaO54693 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EdaO54693 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EdaO54693 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EdaO54693 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EdaO54693 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EdaO54693 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EdaO54693 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EdaO54693 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EdaO54693 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EdaO54693 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EdaO54693 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EdaO54693 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms