Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sdc4O35988 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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