Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Olfr1511-202ENSMUST00000214168 1468 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lhx8O35652 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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