Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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Dgcr6O35347 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Dgcr6O35347 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Dgcr6O35347 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dgcr6O35347 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dgcr6O35347 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dgcr6O35347 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dgcr6O35347 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dgcr6O35347 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dgcr6O35347 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dgcr6O35347 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dgcr6O35347 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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