Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ArxO35085 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ArxO35085 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ArxO35085 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ArxO35085 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ArxO35085 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ArxO35085 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ArxO35085 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ArxO35085 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ArxO35085 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ArxO35085 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ArxO35085 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ArxO35085 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ArxO35085 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ArxO35085 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ArxO35085 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ArxO35085 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ArxO35085 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ArxO35085 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ArxO35085 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ArxO35085 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ArxO35085 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ArxO35085 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ArxO35085 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ArxO35085 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ArxO35085 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ArxO35085 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ArxO35085 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ArxO35085 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ArxO35085 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ArxO35085 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ArxO35085 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ArxO35085 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ArxO35085 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ArxO35085 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ArxO35085 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ArxO35085 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ArxO35085 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ArxO35085 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ArxO35085 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ArxO35085 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ArxO35085 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ArxO35085 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ArxO35085 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ArxO35085 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ArxO35085 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ArxO35085 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ArxO35085 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ArxO35085 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ArxO35085 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ArxO35085 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ArxO35085 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ArxO35085 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ArxO35085 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ArxO35085 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ArxO35085 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ArxO35085 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ArxO35085 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ArxO35085 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ArxO35085 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ArxO35085 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ArxO35085 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ArxO35085 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ArxO35085 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ArxO35085 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ArxO35085 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ArxO35085 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ArxO35085 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ArxO35085 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ArxO35085 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ArxO35085 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ArxO35085 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ArxO35085 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ArxO35085 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ArxO35085 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ArxO35085 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ArxO35085 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ArxO35085 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ArxO35085 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ArxO35085 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms