Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Eftud2O08810 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms