Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm2888K7N746 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm2888K7N746 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm2888K7N746 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm2888K7N746 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm2888K7N746 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms