Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
BC024978J3QPC3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC024978J3QPC3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms