Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3415J3QMS8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms