Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm3336J3QMQ6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm3336J3QMQ6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm3336J3QMQ6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Gm3336J3QMQ6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Gm3336J3QMQ6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3336J3QMQ6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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