Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm21818J3KMS6 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm21818J3KMS6 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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