Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sclt1G5E861 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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