Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Tsc1-201ENSMUST00000028155 7674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ctnnd1-210ENSMUST00000111684 6021 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Olfr1090-203ENSMUST00000217043 2054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Mef2c-218ENSMUST00000198199 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Bmf-202ENSMUST00000110859 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ep400-203ENSMUST00000112435 10420 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Phf21a-204ENSMUST00000111290 6332 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Acad10-201ENSMUST00000031412 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Olfr1532-ps1-202ENSMUST00000207492 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Olfr1532-ps1-203ENSMUST00000215949 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Sipa1l2-201ENSMUST00000108775 6365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Mid1-205ENSMUST00000112105 3974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Asxl2-202ENSMUST00000111215 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 D130017N08Rik-202ENSMUST00000180951 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Mtf1-201ENSMUST00000030723 7631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Serpinc1-201ENSMUST00000064725 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm45017-201ENSMUST00000206842 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Slc2a1-201ENSMUST00000030398 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Nt5c1b-217ENSMUST00000219826 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms