Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm5218F6YH22 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms