Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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R3hdm1E9Q9Q2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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R3hdm1E9Q9Q2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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R3hdm1E9Q9Q2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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R3hdm1E9Q9Q2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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R3hdm1E9Q9Q2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
R3hdm1E9Q9Q2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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