Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Ddx60E9PZQ1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ddx60E9PZQ1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ddx60E9PZQ1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ddx60E9PZQ1 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ddx60E9PZQ1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ddx60E9PZQ1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ddx60E9PZQ1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ddx60E9PZQ1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms