Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc175E9PVB3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms