Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprbB2RU80 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms