Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prrt4B2RU40 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt4B2RU40 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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