Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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Zbed5B2RPU8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Zbed5B2RPU8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Zbed5B2RPU8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Zbed5B2RPU8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed5B2RPU8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed5B2RPU8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed5B2RPU8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed5B2RPU8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed5B2RPU8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed5B2RPU8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed5B2RPU8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed5B2RPU8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed5B2RPU8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed5B2RPU8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed5B2RPU8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed5B2RPU8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed5B2RPU8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed5B2RPU8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed5B2RPU8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed5B2RPU8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed5B2RPU8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed5B2RPU8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbed5B2RPU8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms