Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CK137956B1AYM9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms