Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef20B1ARV6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms