Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtprsB0V2N1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtprsB0V2N1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprsB0V2N1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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PtprsB0V2N1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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PtprsB0V2N1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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PtprsB0V2N1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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PtprsB0V2N1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtprsB0V2N1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtprsB0V2N1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PtprsB0V2N1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PtprsB0V2N1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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