Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prr16A3KMN5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr16A3KMN5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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