Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Odf2A3KGV1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms