Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Palm3A2TJV2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms